Sadržaj

• Sadržaj: Razlika između biblioteke Genomic i knjižnice cDNA
• Usporedni grafikon
• Što je Genomska knjižnica?
• Što je cDNA knjižnica?
• Ključne razlike

Genska knjižnica i cDNA knjižnica koriste se u kloniranju gena za izoliranje različitih DNK. Razlika između obje ove knjižnice je da genomska knjižnica sadrži fragmente DNA koji izražavaju cjelokupni genom organizma, dok se u biblioteci cDNA, mRNA uzima iz određenih stanica organizma, a zatim se cDNA sastoji od te mRNA u reakciji koja se katalizira enzimom.

Sadržaj: Razlika između biblioteke Genomic i knjižnice cDNA

• Usporedni grafikon
• Što je Genomska knjižnica?
• Što je cDNA knjižnica?
• Ključne razlike

Usporedni grafikon

osnova	Genomska knjižnica	cDNA knjižnica
definicija	Genomska knjižnica je zbirka cjelokupne genomske DNK iz jednog organizma. DNK je pohranjena u populaciji sličnih vektora, od kojih svaki sadrži različiti umetak DNK.	Knjižnica cDNA je spoj kloniranih fragmenata cDNA umetnutih u izbor stanica domaćina, što zajedno čini dio transkripta organizma.
Izraz	Čitav genom	Samo specifični geni.
Veličina	veći	Manji
introna	Trenutno	Odsutan
Vektor	Za smještaj velikih fragmenata koristi plazmide, kosmid, lambda fag, YAC i BAC.	Nisu introni, tako da za smještaj skromnih fragmenata koristi plazmide, fagemide, lambda fag.

Što je Genomska knjižnica?

Pri postupku kloniranja gena interesni gen se kopira iz DNA odvojene od organizma. Kad se DNA odvoji od organizma, njegovi se geni oduzimaju odjednom. DNK organizma sadrži tisuće različitih gena. Genetski inženjer pronašao je jedan specifični gen koji kodira određeni protein koji nas zanima.

Ne postoji apsolutno niti jedna metoda kojom je određeni gen iz DNK dostupan, tako da znanstvenici prave genske biblioteke za katalogizaciju DNK organizma. Znanstvenici, zatim biraju željeni gen u knjižnici. Genska knjižnica je skupina kolonija živih bakterija koje su transformisane jedinstvenim komadima DNK u organizmu koji su porijeklo željenog gena. DNK se izvlači iz organizma kako bi se izgradila biblioteka koja je organizirani oblik DNK. Genomska knjižnica i cDNA dvije su vrste biblioteka gena. Brojne tehnike kloniranja gena korištene su kao genske strategije u rekombinantnoj tehnologiji.

Fragmenti DNA su odvojeni rezanjem sa specifičnim restrikcijskim enzimima iz matične DNK. Ti se fragmenti vežu na vektorske molekule, a nakupljene molekule se premještaju u stanice domaćina, po 1 molekula u svakoj stanici. Genomska biblioteka sastoji se od introna, bezvrijedne DNA i niza drugih fragmenata. Unutar ove biblioteke DNA se razbija na manje fragmente unutar stanice. Nakon toga, svi mali dijelovi su umetnuti u vektor da bi se stvorila knjižnica. Genomska knjižnica sadrži svu DNK cijelih gena, a stanica sadrži sve njihove introne. Genomska DNA je prijevod cijelog genoma. Ne broji cijeli dio na jednom kodonu zbog veličine introna. Ne postoji mehanizam spajanja gena u biblioteci koji uzrokuje poteškoće u ekspresiji gena uzetih iz ove biblioteke.

Što je cDNA knjižnica?

cDNA knjižnica je konstruirana odabirom jednog tkiva ili vrste stanice. Nakon toga mRNA se izolira iz tog tkiva ili stanice. DNA kopija molekule mRNA sastoji se od specifičnog enzima reverzne transkriptaze. Dakle, knjižnica cDNA sadrži onu specifičnu DNK koja je prisutna u mRNA. U ovoj biblioteci nisu pronađeni introni i DNK slijed. Unutar ove biblioteke svi su klonovi pune dužine. Nadalje, klon cDNA neophodan je za transficiranje stanica za proizvodnju proteina ili za ispitivanje zasnovano na stanicama.

Ključne razlike

1. Genomska biblioteka napisana je izravno iz genomske DNK.
2. cDNA knjižnica je formirana korištenjem mRNA kao predloška.
3. Genomska biblioteka zauzima čitav genom ovog organizma.
4. cDNA knjižnica predstavlja samo gene određenih bolesti.
5. Dva enzima, restrikcijska endonukleaza i ligaze važni su za izgradnju genomske biblioteke.
6. Enzim reverzne transkriptaze igra značajnu ulogu u izgradnji biblioteke cDNA.
7. Genomska knjižnica zauzima DNK i prokariotskih i eukariotskih organizama.
8. cDNA knjižnica predstavlja DNK upravo eukariotskih organizama.
9. cDNA knjižnica je sposobna ekspresije genoma u bakterijama koje su prokariotske jer im nedostaju introni.
10. Genomska biblioteka nije sposobna reći u prokariotskom organizmu jer oni imaju introne, a prokariotski organizam nema uređaje za obradu introna.